Miuul Logo
Biyoinformatik Bootcamp
Şimdi Başvur
Sohbete Başla

Biyoinformatik Bootcamp

Bu programla yaşam bilimlerinin uçsuz bucaksız veri ormanına birlikte girip biyoinformatik metotların imkanlarını ve sınırlarını Genomik sahasında keşfetmeyi hedefliyoruz

10 Hafta

Sektörden Mentorler

5+ Proje

7/24 Destek

Sertifika

Eğitmen

Dr.Zeynep Akdeniz

PROGRAM

Biyoinformatik Bootcamp

Hafta 1 4 Saat

Büyülü Bir Dil Öğrenme Zamanı: Python ile Bilgisayarların Dünyasına Giriş!

Harry Potter Parseltongue analojsi:

Tıpkı büyülü bir dünya olan Hogwarts'da sıradan bir çocuk olan Harry Potter'ın Parseltongue ile yılanlarla konuştuğunu keşfettiği gibi, siz de bilgisayarlarla konuşmanın gizemli dilini, Python'u öğreneceksiniz. Harry Parseltongue’la yılanlar dünyasına giriş yaptı, Python ise size dijital dünyanın kapılarını aralayacak. Düşünsenize, öyle bir dil ki, sadece birkaç satır yazarak düşüncelerinizi dijital bir gerçekliğe dönüştürebilirsiniz. Python öğrenmek, size kendi büyü çubuğunuzla bilgisayarları kontrol etme gücünü verir. Haydi canlanın, büyü çubuklarınızı (klavyelerinizi) elinize alın ve bu büyülü dijital dünyada yepyeni bir maceraya atılın! 

Hafta 2 4 Saat

Biyoinformatikle Geleceğe Bir Yolculuk: Snakemake Boru Hatları Kullanımı

Biyoinformatik, biyolojik verinin bilgisayar teknolojisiyle yorumlanmasını sağlayan, hem biyoloji hem de bilgisayar bilimlerini kapsayan hibrit bir alandır. Geçtiğimiz yıllarda, genetik ve protein bilgisi üzerindeki bilimsel bilgi birikiminin katlanarak artması, bu alana olan ihtiyacı daha da belirgin hale getirdi. Bu bilgiler ışığında, genetik ve proteomik veri analizi üzerine odaklanan çeşitli alanlarda göz alıcı gelişmeler gözlemlenmektedir. Şimdi bu konuyu biraz daha ilginç hale getirelim ve bu konulara bir bilim kurgu dokunuşu ekleyelim.

Hafta 3 4 Saat

Biyoinformatik Simyacıları: Ham Veriden Altın Bilgiye Dönüşüm

Biyoinformatik veritabanları ve metodları:

Biyoinformatik, bir simyacı'nın laboratuvarındaki gizemli süreçlere benzer şekilde, veriyi anlamlı bilgiye dönüştürür. Kırılgan metalleri altına dönüştürme sanatı simyada olduğu gibi, biyoinformatikçiler de gen veya protein sekansları gibi ham verileri biyolojik hikayelere çevirirler. Veri temizleme, simyada saflaştırma işlemine benzer, hataları ayıklar ve eksiklikleri tamamlar. Bunu takiben veri dönüşümü, altın yaratma süreci gibidir; DNA dizilerini analize uygun formatlara çevirir. Sonuçta ise 'altın' elde edilir; gen işlevlerini anlama veya hastalıklara sebep olan genetik varyasyonları bulma gibi değerli bilgiler.


 

Hafta 4 4 Saat

Biyoinformatik Uzay Gemisi

Biyoinformatikte Veritabanları, API'ler ve Yazılım Araçları: Uzay Analojisi:

Haydi şimdi aşağıdaki terimleri tanımlanan yazılım araçları ile eşleştirelim;

NCBI, Blast, biopython, SeqIO, Seq, pandas, inteproscan, IPR, protein sequence

NCBIVeritabanı: Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi (NCBI), GenBank gibi biyolojik veritabanlarına erişim sağlayan bir kurumdur. Örneğin, GenBank'te her biri DNA dizilerini temsil eden milyonlarca kayıt bulunur.

BlastYazılım Paketi: BLAST (Basic Local Alignment Search Tool), genetik diziler arasında benzerlik aramaları yapmak için kullanılan bir yazılım paketidir. Örneğin, belirli bir DNA dizisiyle ilgili olarak diğer veritabanındaki benzer dizileri araştırmak için BLAST aracını kullanabilirsiniz.



 

Hafta 5 4 Saat

Biyogenetik Bulmaca: Genom Montajı

Genom Montajı, Yeni jenerasyon dizilime teknolojileri:

Biyoinformatik dünyası, genetik bilginin keşfedilmesinde büyüleyici bir macera sunar. Hepimiz çocukluğumuzdan hatırlarız, Humpty Dumpty'nin bir duvarın üstünde oturduğunu ve ne yazık ki düşüp parçalandığını. Aynı şekilde, genom da karmaşık bir yapboz gibidir. Genetik bilginin büyük bir bölümü bu yapbozun içinde saklıdır. Humpty Dumpty, yumurta olarak genomu temsil eder - genetik bilginin geniş bir koleksiyonu. Genom dizilimi, Humpty Dumpty'nin parçalanmış parçalarını dikkatlice bir araya getirme sürecine benzer. Bilim insanları DNA parçacıklarını titizlikle diziler ve analiz eder, tıpkı Humpty Dumpty'nin kabuk parçalarını orijinal şekline yerleştirmeye çalıştıkları gibi.


 

Hafta 6 4 Saat

Karşılaştırmalı Genomik: Genom Etiketleri

Parazit yaşam’dan özgürlüğe kaçışın hikayesi H. inflata :

Genom etiketleri, domain, aile, süperaile

Bir sanat sergisine katıldığınızı ve iki ayrı ancak ilgili sanat eserini incelediğinizi hayal edin. Ancak bu sanat eserleri resim veya heykel değil, diplomonad adı verilen protistlerin iki farklı türü olsun: Özgür yaşayan bir organizma olan Hexamita inflata ve parazitik bir organizma olan Giardia intestinalis. Hexamita inflata'nın tuvali, yani genomu, özgür ruhlu bir sanatçının hayatını çizen renklerin ve formların girdabı gibidir. Daha geniş bir genetik repertuara, çeşitli renk paletine benzer şekilde sahip olması, çeşitli çevrelerde hayatta kalabilmesine ve besinlerini çeşitli kaynaklardan elde edebilmesine olanak sağlar. Bunu yapmasına izin veren genler, bağımsızlığını ve uyum yeteneğini ortaya koyan detaylı fırça darbeleri gibidir.

Hafta 7 4 Saat

Genomik Orkestra: Dizi Karşılaştırma ve Kümeleme

Karşılaştırmalı genomik analizler:

Çiftli dizi karşılaştırma ve ortolog kümeleme, karşılaştırmalı genetik incelemesinde farklı enstrümanları kullanmak gibidir. Her biri, Hexamita inflata ve Giardia intestinalis gibi özgür yaşam ve parazit diplomonadların genetik eserlerini farklı açılardan incelememize yardımcı olur.

Hafta 8 4 Saat

Dünya’nın ‘Genomu’ : Genomik Uzay Mimarisi

Genomik analizler

Haydi biyoloji ve astrofizik kavramlarını birleştiren bir senaryo hayal edelim:

Dünyamız, tıpkı bir yaşam formu gibi, farklı yaşam alanlarını dolduran organizmalar gibi gök cisimleriyle dolu geniş kozmosa yerleştirilmiştir. Organizmaların zamanla çevrelerine olan evrimsel adaptasyonları, Dünya gibi gök cisimlerinin kendi göksel çevrelerindeki durumlara nasıl uyum sağladığına benzetilebilir.

Bu benzetmede, asteroid çarpışmaları mutasyonlargenetik rekombinasyon ve yatay gen transferi gibi, bir organizmanın genetik koduna yeni elementler ekleyen olaylarla eşleştirilebilir. Bu 'çarpışmalar' bazen zararlı (deleterious mutasyonlar veya genetik hastalıklar gibi), bazen nötr (sessiz mutasyonlar) veya ara sıra avantajlı olabilir (faydalı özelliklere yol açan pozitif mutasyonlar).

Dünyamız, oluşumundan bu yana sayısız asteroidle karşılaştı, tıpkı bir organizmanın yaşamı boyunca sayısız genetik değişiklik geçirmesi gibi. Bu çarpışmaların bazıları gerçekten önemli olaylara yol açmıştır, örneğin dinozorların yok olması, hızlı evrim ve biyoçeşitliliği tetiklemiştir, bu da gen çoğaltma gibi olaylara benzer işlevsel çeşitliliğe yol açar


 

Projeler

Eğitim içeriklerini gerçek iş dünyası projeleriyle güçlendirerek eşsiz kılmak için lider firmalar ile veri sponsorluğu kuruyoruz. Erişeceğiniz projelerin bir kısmına göz atın.
Erken Kayıt İndirimi
Son Gün 29 Şubat

Biyoinformatik Bootcamp

3. Dönem Biyoinformatik Bootcamp programı 25 Mart ile 3 Haziran tarihleri arasında gerçekleştirilecektir.

Canlı Dersler (Online)
Canlı Mentor Desteği
Ücretsiz Ön Hazırlık
5+ Uçtan Uca Proje Deneyimi
Tüm İçeriklere 6 Ay Erişim
Sertifika
Bireysel
500$
400$

Peşin veya taksitli ödeme imkanı

Peşin ödemelerde %5 indirim avantajı

ÖDEME YAP
Öğrenci
400$
350$

Peşin veya taksitli ödeme imkanı

Peşin ödemelerde %5 indirim avantajı

ÖDEME YAP
Sorularınızı Hızlıca Yanıtlayalım
Bize Ulaşın

İhtiyaçlarınızı görüşmek için sizinle iletişime geçeceğiz.

Biyoinformatik Bootcamp
Şimdi başlamaya hazır mısın?

Öğrenmeye bugün başla - şimdi senin zamanın.

Şimdi Başvur